На территории древнего Зарайского кремля находится главный храм города – Никольский собор. Это самое древнее церковное здание на Зарайской земле. Храм, построенный в конце XVII века, хотя и с утратами, сохранился до наших дней. Первая Никольская церковь была бревенчатой. Ее  сложили  для  чудотворного образа иконы Святителя Николая, принесенной из Корсуня (Херсонеса Таврического)  в 1225 году.
Первые три столетия из своей долгой истории храм, как, впрочем, и другие здания в городе, был деревянным, и, наверное, не раз перестраивался.
В 1528 году начинается новый этап градостроительства в Зарайске – эпоха каменного зодчества. Тогда был возведен каменный Никольский храм, и началось сооружение кремля. Через полтора столетия церковное здание пришло в ветхость, и на смену ему,  по Указу Государя Федора Алексеевича,  в 1681 году воздвигли каменный пятиглавый Никольский собор.
За правым клиросом, в древнем киоте, в окружении свечей и лампад, стояла главная святыня собора - чудотворная икона Николы Зарайского. К ней стекались верующие для молитвы Великому Угоднику Божию.
Среди богомольцев были не только простые люди – крестьяне, ремесленники, купцы, но и  представители высшего сословия – родовитые дворяне, Великие князья и даже Государи. Известно, что икону Николы Зарайского чтил преподобный Сергий Радонежский и совершал перед ней молебны.  В Зарайск, на богомолье, приезжал царь Иван Грозный со своим сыном.
Хранитель великой православной святыни, Никольский храм благоукрашался на пожертвования верующих. Росписи покрывали стены и своды, изображения святых  находились даже на железных кованых дверях.  В XVIII  столетии в соборе появился великолепный барочный иконостас  с мотивами рокайля  и круглой скульптурой. Во второй половине XIX века  в храме обновили живопись и устроили новую кровлю. Благодаря собранным церковным ценностям, внутреннему убранству и великолепному резному иконостасу собор выделялся среди других зарайских храмов.
Прославился собор и своими настоятелями. Это, прежде всего, священник Евстафий, принесший икону из Корсуни, и его потомки, служившие в храме почти четыреста лет. Незаурядным государственным деятелем был протопоп Никольского храма Димитрий Леонтьев - сподвижник зарайского воеводы князя Димитрия Пожарского. Протопоп Димитрий участвовал в работе Земского Собора 1613 года и входил в состав посольства, которое отправилось в Кострому просить на царство Михаила Романова.
Собор закрыли в 1919 году, и помещение отдали под музейную экспозицию. В то время убранство храма сохранялось в неприкосновенности. Но позже,  когда сюда переселился архив, а затем и склад,  разломали паперти, из собора исчезли иконы  в богатых окладах, церковная утварь, книги, резная скульптура, детали  иконостаса.
В начале ХХ века последним настоятелем собора перед его закрытием был митрофорный протоиерей Иоанн Смирнов, пострадавший в годы гонений за веру Христову. Он был расстрелян на Бутовском полигоне 9 сентября 1937 года. В 2000 году Архиерейским Собором Русской Православной Церкви священномученик  Иоанн прославлен в лике новомучеников Российских.
Духовное возрождение  Зарайского края началось с Никольского собора в 1990-х годах. 7 января 1992 г. в древних стенах впервые после долгих десятилетий звучали молитвы и торжественные песнопения Божественной литургии. Ныне церковный приход Никольского собора – самый многочисленный и активно развивающийся.
В настоящее время ведётся реставрация фасада собора. Внутренняя реставрация, возобновление убранства  и реставрация иконостаса осуществляется Почетным гражданином Зарайска Никитой Юрьевичем Чаплиным.
Богослужения совершаются в приписном Иоанно-Предтеченском соборе. Настоятель собора - благочинный церквей Зарайского округа, протоиерей Петр Спиридонов.
Престольные праздники:
22 мая, 19 декабря - святитель Николай, архиепископ Мир Ликийских, чудотворец.
Дни памяти:
9 сентября – сщмч. Иоанн Смирнов;
11 сентября – собор новомучеников и исповедников Зарайских
Настоятель:  протоиерей Петр Спиридонов.
Староста: Почетный гражданин Зарайска Никита Юрьевич Чаплин.
Храм открыт ежедневно с 8:00 до 18:00.
Адрес: 140600 Московская область, г.о. Зарайск, пл. Пожарского, д.13.